东北大学档案馆在原科技档案室、文书财务档案室、人事档案室的基础上，于1988年2月正式成立，2003年4月通过国家档案局考评认证，晋升为“国家科技事业单位档案管理国家一级”。2003年9月学校建成了东北大学校史馆，归属档案馆。档案馆已经建设成为学校档案保管基地、爱国主义教育基地和校史研究基地，竭诚为学校和社会建设提供档案信息服务。

东北大学档案馆位于东北大学南侧，建筑面积1457平方米，现保存东北大学和沈阳黄金学院2个档案全宗。档案分为党群、行政、教学、科研、产品与科技开发、基建、仪器设备、出版、外事、财会、人物、声像及人事十三个类别。

在学校的大力支持下，全楼安装了网络通讯系统、烟感防火装置、红外线防盗系统，配备了空调、加湿器等完善的硬件设备；开发了具有自主知识产权的档案信息集成管理系统。

东北大学档案馆为正处级单位，馆长韩子秋，副馆长李春雷，目前在编人员17人，全部具有大学本科及以上学历，其中5人具有高级技术职称；同时返聘教授及副教授4人协助校史编研工作。档案馆下设业务指导室、档案管理室和校史志编研室三个科室。

近年来，档案馆以档案管理信息化建设为重点，建成了档案信息集成管理系统；组建了信息资源库开发、维护、管理的专业技术队伍和应急、指挥、处理的技术支撑队伍；组建了提供咨询、论证服务的专家库。档案馆积极推进电子文件归档，努力实现文档一体化，促进档案的收集、整理方式的改革，极大的推进了馆藏档案的数字化，使档案搜集、保管和利用的流程更加贴近时代和受众的需要。

同时，档案馆高度重视档案编研和校史研究工作，已先后完成了《东北大学校志》第一卷（1923.4-1949.2）、《东北大学校志》第二卷（1949.2-1993.3）、《东北大学史迹画卷》、《东北大学复名的前前后后》、《东北大学的历程》等校史书籍的编纂和出版。

档案馆紧紧围绕学校“推进一流大学和学科建设”的建设目标，本着“保存历史、服务现实、着想未来”的原则，充分发挥档案馆的“搜集、存证、服务、创新”功能，坚持“围绕大局、服务中心”的工作定位积极开展档案工作，并通过各种途径对全校教职工及专兼职档案人员开展档案法制宣传、教育以及业务指导，多次获得辽宁省、沈阳市档案工作先进集体、档案工作示范学校等光荣称号。东北大学校史馆先后被评为沈阳市爱国主义教育基地、沈阳市国防教育基地。